该研究通过结合长读长（PacBio CCS模式）和短读长（Illumina）测序技术，构建了一个包含21,646个非冗余噬菌体基因组的中国人类肠道噬菌体（CHGV）目录。为避免由基因组片段导致的偏差，研究人员进一步筛选，只保留了完整度≥90%的8,848个噬菌体基因组。研究发现了8,448,009个甲基化位点，其中51.14%为m4C修饰，48.85%为m6A修饰。在8,848个噬菌体中，97.5%的噬菌体（8,630个）被甲基化，96.6%的噬菌体（8,549个）包含这两种修饰类型。此外，研究还鉴定出157个甲基化motif，其中包括两个之前未发现的新motif。
图2 CHGV-HQ基因组的DNA甲基化分布模式
图3 噬菌体编码的MTase在肠道噬菌体中普遍存在
图4 噬菌体和细菌编码MTase具有高度同源性，可用于高精度预测噬菌体-宿主关系华中科技大学生命科学与技术学院博士研究生孙楚晴为该论文第一作者，华中科技大学陈卫华教授和刘智教授、以及复旦大学赵兴明教授和欧洲分子生物学实验室Peer Bork教授为该论文共同通讯作者。该研究得到国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的支持。
内容部分来源于 BioArtMED
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